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故事描述源起於 2029 年 3 月，當時發生了堪稱是戰後最大事件的「總理大臣暗殺事件」。草薙素子的前上司、任職於陸軍 501 機關的徠津也是事件受害者之一…。素子聚集了巴特、以及德古沙等夥伴開始進行搜查。在事件背後竟是義體開發的技術障礙「死亡終結」所牽扯到的政治陰謀，以及電腦病毒「火種」的存在。

一窺擁有數百年壽命的伊歐夫地區人民，如何活出傳說！ 伊歐夫人民擁有數百年的壽命，卻永遠保持著十五歲的外表，因而被視作「活著的傳說」。一日，梅薩帝軍為求長壽之血，對伊歐夫地區展開猛烈的攻擊，打亂了他們習以為常的平靜生活。在一片混亂之中，失去雙親的伊歐夫少女瑪琪亞、少年克里姆、伊歐夫第一美女蕾莉亞，竟

講述在與上海龍虎幫的騙局中失敗，本應喪命的桃樂絲，卻出現在離亞洲都市．台北有些距離的海邊小村莊。在台北黑社會的追捕之下，前往京都的桃樂絲，將會有什麼在等待著她？

日本第五次聖杯戰爭結束後，美國西部的史諾菲爾德出現了充滿虛偽的聖杯戰爭，魔術師和英靈們即使深知這是場虛偽的聖杯戰爭，仍舊在此之上不斷舞動。不在乎真假，只為貫徹自身的信念。

劇場版的事件發生在動畫第一期結束後4年，2112年時擔任新人監視官的「常守朱」與執行官「狡嚙慎也」，和某位名為「槙島聖護」的男子相遇，而槙島身為某起事件幕後黑手，他動搖了維持世界和平的系統，並質疑其正當性。最後遭到狡嚙制裁後失去行蹤。 時間來到2116年，日本政府開始向海外戰亂國出口名為「Siby

一場國際水資源交易會上爆發警員大屠殺群眾事件，背後是駭客「火種」的技術所造成，其有入侵電子腦操控任何人的能力，電子世界陷入莫大危機，草薙小隊將力挽狂瀾。

2027年6月6日，在熱鬧的市區街道上，屬於陸軍機密部隊501機關的真室中佐被殺，在這之前，他陷入一樁跟軍火買賣有關的貪污弊案，因此他的被殺事件背後有著無數的謎團。 在某個夜晚，警察單位的九課課長荒卷大輔想拿回真室的電子腦，因而在真室中佐的墳墓邊遇到了生化人草薙素子，這是他們第一次相遇。這個時候的

小國卡爾迪斯的獨立戰爭在多年以前被鎮壓，領導斯庫拉薩斯也被殺，然他卻又疑似復活在日本主導多起恐怖爆炸案，草薙小隊奉命調查真相。

梵谷名畫《向日葵》被發現，並將在紐約拍賣，然而在《向日葵》的發現地卻發生了殺人事件。在紐約拍賣會現場，全世界的大富豪匯集一堂，競拍《向日葵》。鈴木次郎吉以遠高於他人出價的3億美金將此畫拍下，他的目的是集齊散落在世界各地的7幅《向日葵》，以此能在日本舉辦史無前例的大規模展會。這則夢幻大新聞向全世界播出

《Arise》於2015年重製成10集電視動畫《攻殻機動隊Arise - Alternative Architecture》，前八集由劇場版四部曲重新剪輯而成，最後兩集「Pyrophoric Cult」為完全新作故事，內容則是圍繞著將故事導引至《攻殼機動隊 新劇場版》的電子腦病毒：火種，所帶來的衝擊

宇宙世紀 0079、地球聯邦和吉翁公國之間的一年戰爭末期。SIDE 4 中漂流著宇宙殖民地群、姆亞殘骸的暗礁宙域，由於交織著帶電太空垃圾所引發的閃電，而被稱為「雷霆宙域」。為了搶回這片宙域，隸屬聯邦軍的姆亞同胞團開始展開作戰。迎擊的對手則是吉翁軍的活死人師團。雖為姆亞同胞團一員，卻對受限於故鄉一事不

《義大利遊戲》與《魯邦三世》系列電視動畫的故事一脈相承。在電視動畫中出現的角色瑞貝卡·羅塞莉尼(レベッカ·ロッセリーニ)也將在這次的SP動畫中登場，圍繞「卡里奧斯特羅伯爵的遺產」展開一段驚險刺激的故事。