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污垢達人正計畫將整個地球變成一個大溫泉，政府的秘密組織溫泉G 組為了阻止他們的野心，到處尋找黃金之魂溫泉，希望借溫泉的神力打倒壞蛋。沒想到黃金之魂溫泉居然就在小新家的地底下，就這樣他們一家人捲入了守護溫泉的正邪之戰，最後因為小新一家人同心協力，終於打倒了污垢達人，拯救世界和平。

本作為超級英雄大戰系列第五彈，也是平成最後一部春季劇場版。 本作引進《假面騎士EX-AID》遊戲要素，也同時在《假面騎士平成Generations Dr.Pac-Man對EX-AID&Ghost with 傳說騎士》之後，再次與經典遊戲鐵板陣（Xevious）及小蜜蜂（Galaxian）合作。

身份不明的遊戲病毒生命體「Pac-Man」來襲，人類將陷入前所未聞的危機。以恐怖的趨勢擴大感染中，天空寺尊（假面騎士Ghost）也因為感染上這種病毒，失去了變身的能力。另一方面寶生永夢（假面騎士Ex-Aid）追查敵人的真面目及感染源，但那正左右他自身的命運的「重大的真實」有著連繫關係。被堵住去路的E

故事發生在被天牆分為三塊的假面騎士Build的世界，竟然出現了假面騎士Ex-aid世界的敵人「缺陷者病毒」而展開冒險。為何不該出現在這的敵人會來到這世界？面對神祕敵人而毫無應對方法的戰兔，一個身體半邊被金屬覆蓋的神祕男人突然出現在他眼前！

這個世界幸福嗎……？試圖毀滅現實世界，並打算支配ＶＲ《虛擬實境》空間的忍者集團突然現身，他們準備要創造可以讓所有人從絕望中解放的「永遠的天堂」。「即將消失的渺小生命」「忍者假面騎士」「光之手裏劍」「夢境大運動會」「生化攻擊」「Pipupepo恐慌」「I am God」「幻夢VR」「最強的最終頭目」─