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貝多芬與吳阿秋這兩個精煉幹探，不單只是工作上的好拍檔，二人更視對方為知己良朋。秋與芬奉命保護重要證人羅美美，但美美天性好動，不喜被貼身保護，遂設計逃走，引來追殺危機，秋更為保護美美而受傷進院。秋以為自己身患絕症，遂奮不顧身，保護芬與美美，擊退殺手。後秋得知「絕症」只不過是電腦失靈所造成的誤會，如釋重

《智勇三寶》由港產片多位笑匠合作，包括：《半斤八両》許冠文、《奇謀妙計五福星》吳耀漢和《神勇雙響砲》岑建勳。《智勇三寶》英文片名「Mr Boo Meets Pom Pom」，分別取材於許冠文的成名作《半斤八両》日本版名稱（Mr Boo!），以及吳耀漢和岑建勳前作《神勇雙響炮》（Pom Pom）。電影