“”電影

木葉的根人正在度過一個充滿比賽、障礙賽，當然還有接力賽的運動日，獲勝者的獎品是帶薪假期。不幸的是，鳴人和他的胃再次給他帶來了麻煩。

2000年春假，在第一次冒險結束後的某一天，網際網路上出現了一個神秘的數碼蛋，數碼蛋孵出一隻神秘數碼獸（水母獸）之後便開始不斷吞食數據並迅速進化成（指爪獸），造成電腦網路世界的混亂。光子郎跑到太一家告知其事情，而太一也馬上聯絡各同伴，但此時此刻，美美在夏威夷，阿空在生太一的氣，阿丈在準備初中入學考試

為了削弱統治新世界的四皇其中一支勢力，和托拉法爾加·羅結為海賊同盟的魯夫等人闖入多雷斯羅薩。魯夫在那裡得知他已故的哥哥艾斯的「火焰果實」將成為鬥牛鬥技場競技秀的獎品，為了不讓「火焰果實」交給任何人，他遂以化名魯西之名參加大賽。另一方面，以革命軍一員的身分進行活動的「另一個哥哥」薩波也和同伴一起潛入多

在因「重啟」而被重新啟動的數碼世界，被選召的孩子們和搭檔數碼獸們重逢。然而，緬因貓獸仍保存有以往的記憶，為尋找芽心卻消失了。在尋找緬因貓獸的過程中，出現了一名身份不明的男子。男子揭露「重啟」是世界樹的意志，孩子們則被機械邪龍獸和鋼鐵海龍獸攻擊。產生共鳴的孩子們與數碼獸搭檔再次究極進化，擊退了機械邪龍

在月島綜合高校文化祭當天，會場出現神秘男子，企圖把緬因貓獸帶到空間扭曲的彼方。碰巧相遇的巴魯獸、哥瑪獸、獅子獸進入扭曲救助，卻被謎之男子召喚的帝皇龍甲獸阻止。為了救出緬因貓獸，巴魯獸、哥瑪獸實現了究極進化。然而，緬因貓獸被救出後突發異變，眨眼間就消滅了獅子獸，獨自消失在空間扭曲深處。此時，姬川真希道

緬因貓獸突然發生變異來到了現實世界，被世界樹所操控的數碼獸也陸續登場。在世界崩壞危機之中，孩子們被強制返回到現實世界。在藏身於暑假的校園中，尋求拯救現實世界和數碼世界的方法的時候，他們被捲入了世界樹和恆常性雙方的對立之中。緬因貓被以敵意相向，再次變換形態。為了拯救由於暴走而飽受折磨的緬因貓獸，芽心最

『即使如東京般的繁華城市，夜晚還是不要玩捉迷藏好。因為，晚上玩捉迷藏的話會被鬼抓走。』 在這座荒廢渾沌的城市裡存在著一個縫隙。 在入夜之後，路燈亮起之時，這個縫隙的彼端便會出現一個只有小孩才能進入的世界。 傳說來到這裡就能與「鬼」的異形一起玩「御常世大人的遊戲」，以及絕對秘密遊戲：「捉迷藏」。

光之美少女們意外進入了夢的世界，在那裡遇到了可以操縱夢的妖精，並且陷入危險之中......最後解決了惡夢獸也解救了孩子。